Las Catacumbas del Convento de los Capuchinos son en realidad un cementerio subterráneo del siglo XVII excavado en la toba. Contiene 8.000 cadáveres embalsamados que vivieron entre los siglos XVII y XIX. Es una estructura de 300m2 dividida en cuatro corredores: el de los sacerdotes, el de los hombres, el de las mujeres y el de los profesionales. Se entra por el lado izquierdo de la fachada principal de la iglesia de la Madonna della Pace. Los cuerpos, ataviados con ropa de época, están identificados con nombre, apellido y fecha de defunción. En el pasillo de profesionales también está el cuerpo embalsamado del pintor Giuseppe Velasquez.
Poco se sabe sobre el método que utilizaron los frailes capuchinos para conservar los cuerpos. Era común deshidratar los cuerpos de forma natural en los coladeros, luego lavarlos con vinagre, exponerlos al aire libre por algunos días, luego vestirlos y colocarlos en nichos o cajones de madera. En cambio, se daba un baño de arsénico y lechada de cal a los muertos por epidemias.